Escrt-III

Escrt-III Model

Escrt-III est un complexe protéique capable de découper des membranes lipidiques « de l’intérieur ». Ce complexe est impliqué notamment dans le relarguage des virus enveloppés type VIH, mais aussi dans la division cellulaire et dans le traffic endomembranaire.

Comment ESCRT – III s’assemble sur la membrane ? Comment cet assemblage déforme et coupe la membrane ?

Mon projet de post doctorat, effectué dans le laboratoire d’Aurélien Roux, a permis de reconstituer in vitro, sur des membranes modèles, la protéine principale impliquée dans ce complexe.

L’article a été publié dans le journal Cell et a été distingué en couverture:

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Un communiqué de presse et une vidéo présentant notre modèle ont été produits pour l’occasion:

Dans la suite du projet, nous allons plus loin dans la mécanique du complexe.

1\ D’une part en ajoutant un aspect simulation numérique:  un code de calcul écrit en Java et parallélisé en CUDA a permis de comprendre la croissance de larges quantités de polymères tels qu’observés in vitro [50 000 particules au final, 1h30 de calcul sur single CPU et une carte graphique standard].

[si le lecteur ne fonctionne, pas, la vidéo est téléchargeable ici : topnicemov (blue)-nice170216-smallsize]

2\ D’autre part nous continuons notre approche bottom-up dans la reconstitution in vitro du complexe en ajoutant les autres partenaires d’ESCRT-III (7 protéines combinées). Ces nouveaux résultats viennent d’être soumis.

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